Trdlica, L., Soldán, P., Šajer, J., Sezima, T., Šlouf, V., Durčák, M., Gálková-Mojžíšková, H., Luzar, T., Mičaník, T., Badurová, J., Tušil, P. Projekt Odra III 2003-2006. Ostrava : Výzkumný ústav vodhospodářský T.G.Masaryka, v.v.i., 2008, 40 s., ISBN 978-80-85900-81-1.

Mičaník, T., Kořínek, R., Tušil, P. a Soldán, P. Poznej tajemství vědy, Odborná publikace pro popularizaci technických a přírodních věd. . Hrušková, A. (editor), Zamarský,V., Kosík, O., Krejčí, B., Lipina, P., Řepka, M., Stříž, M., Tolasz, (ed.) Ostrava: Nakladatelství odborné literatury ACCENDO při vědecko-výzkumném ústavu ACCENDO – Centrum pro vědu a výzkum, z. ú. 2015. [Kap] Voda, 89-134. ISBN 978-80-87955-03-1.

Kořínek R., Kristová A. Stavební, technologický a architektonický vývoj věžových vodojemů na našem území. In Marek Coufal Sborník přednášek z konference VODA ZLÍN 2020. Zlín, 5. 3. 2020. Olomouc : Moravská vodárenská, a.s., 2020, s. 157-163. ISBN 978-80-905716-6-2.

Robert Kořínek, Alena Kristová Druhý dech věžových vodojemů – využití specifického stavebního dědictví v České republice. In Jana Buchlovičová, Danka Barloková Zborník prednášok z konferencie s medzinárodnou účasťou PITNÁ VODA. Trenčianské Teplice, 8. 10. 2019. Bratislava : VODATÍM s.r.o., 2019, s. 211-217. ISBN 978-80-971272-7-5.

Mičaník, T., Kristová, A. Uranium in a surveying process as a candidate priority substance for water environment under Water Frame Directive. In Hanslík Eduard Radionuklidy a ionizující záření ve vodním hospodářství. Clarion Congress České Budějovice, ČR, 24. 4. 2018. Praha : Výzkumný ústav vodohospodářský T.G.M., v.v.i., 2018, s. 25-30. ISSN N.

Eduard Hanslík, Barbora Sedlářová, Diana Marešová, Eva Juranová, Tomáš Mičaník Nařízení vlády č. 401/2015 sb., radioaktivní látky. In Hanslík Eduard, Petráková Kánská Klára Radiologické metody v hydrosféře 17. hotel Zlatá hvězda Litomyšl, 3. 5. 2017. Chrudim : Vodní zdroje EKOMONITOR spol. s r.o., 2017, s. 48-50. ISBN 978-80-8823800-3.

Micanik, T., Sajer, J., Kotatko, A. Mixing zone designation as a tool for management decision making in the case of the hazardous substances releases into the water environment. In SGEM 12th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2012, Conference Proceedings, Volume V, Ecology andEnvironmental Protection. Albena, Bulgaria, 17. 6. 2012. Sofia, Bulgaria : STEF92 Technology Ltd., Andrey Lyapchev Blvd, 2012, s. 579-586. ISSN 1314-2704.

Mičaník, T., Sýkora, F., Chrastina, D., Cielecká, N., Kucharczyková, V., Kristová, A., Ocelka, T., Oceánský, J. Časoprostorová dynamika vnosu organických látek do vodárenské nádrže Švihov. VTEI – Vodohospodářské vědecko-technické informace, 2020, roč. 2020, č. 2, s. 6-16. ISSN ISSN 0322.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Prchalová, H., Polášek, M., Němejcová, D., Durčák, M., Richter, P. Surface Water Status Assessment for the Third Cycle River Basin Management Plan of the Czech Republic. VTEI – Vodohospodářské vědecko-technické informace, 2020, roč. 2020, č. 6, s. 4-18. ISSN 0322-8916.

Kořínek, R., Kristová, A. Přínosy výzkumného projektu o věžových vodojemech. SOVAK, 2020, roč. 29, č. 7-8, s. 25-29. ISSN 1210-3039.

Mičaník, T., Oceánský, J., Lisník, J., Ocelka, T. Testování sorpčních filtrů na bázi granulovaného aktivního uhlí pro účely dočišťování pitné vody. VTEI – Vodohospodářské vědecko-technické informace, 2020, roč. 2020, č. 2, s. 17-25. ISSN ISSN 0322.

Robert Kořínek, Alena Kristová Nerealizované věžové vodojemy. Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2019, roč. 61, č. 6, s. 4-9. ISSN 0322-8916.

SEZIMA, T.; TUŠIL, P.; DURČÁK, M.; MIČANÍK, T.; KRISTOVÁ, A. Vybrané metody hodnocení životního prostředí. VTEI, 2018, roč. 2018, č. 6, s. 22-24. ISSN 0322–891.

Mičaník T., Hanslík E., Němejcová D., Baudišová D. Klasifikace kvality povrchových vod . Vodohospodářské technicko ekonomické informace , 2017, roč. 59, č. 6/2017, s. 4-11. ISSN 0322-8916.

Tomáš Ocelka, Jiří Oceánský, Romana Kurková, Tomáš Mičaník, Petr Kačer Zhášeče hoření, jejich výskyt v prostředí a metody měření. Chemické listy, 2017, roč. 2017, č. 111, s. 149-155. ISSN 1213-7103.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Tomáš Mičaník, Pavel Rosendorf, Alena Kristová, Jitka Svobodová Postupy hodnocení významnosti zdrojů a cest emisí znečišťujících látek do vody. Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2014, roč. 56, č. 1, s. 2-7. ISSN 0322-8916.

Vyskoč, P., Prchalová, H., Mičaník, T., Rosendorf, P., Kristová, A., Svobodová, J. Postupy hodnocení významnosti zdrojů a cest emisí znečišťujících látek do vody. Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2014, roč. 56, č. 1, s. 2-7. ISSN 0322-8916.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Richter, P., Filippi, R. První vyhodnocení jakosti povrchových vod z hlediska plnění norem environmentální kvality pro prioritní látky a některé další znečišťující látky podle novelizovaného nařízení vlády č. 61/2003 Sb.. VTEI - Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2011, roč. 53, č. 3, s. 20-23. ISSN 0322-8916.

Mičaník, T., Sýkora, F., Truxová, I., Chrastina, D., Kadlčíková, M., Cséri, L. Studium kinetiky sorpce polyaromatických uhlovodíků, kadmia a rtuti na vybrané typy pevných matric a říční sediment. VTEI - Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2011, roč. 53, č. 3, s. 29-31. ISSN 0322-8916.

Durčák, M., Kristová, A. Výskyt vybraných prioritních látek ve vypouštěných vodách z bodových zdrojů znečištění v povodí Odry. Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2011, roč. 53, č. 3, s. 4-9. ISSN 0322-8916.

Krečmerová, P., Mičaník, T. Screening vybraných polutantů v odpadních vodách z komunálních zdrojů znečištění v České republice. VTEI, příloha Vodního hospodářství č. 10 /2009, 2009, roč. 51, č. 5, s. 11-14. ISSN 0322-8916.

Tušil, P., Šajer, J., Durčák, M., Kristová, A. Výskyt relevantních znečišťujících látek v české části Mezinárodní oblasti povodí řeky Odry. VTEI, příloha Vodního hospodářství č. 10/2009, 2009, roč. 59, č. 5, s. 5-8. ISSN 0322-8916.

Mičaník, T., Kučera, J., Sýkora, F., Belda, J., Šajer,J. Problematika stanovení mísicí zóny v kontextu návrhu směrnice ES o normách environmentální kvality a o změně směrnice 2000/60/ES. VTEI, příloha Vodního hospodářství č. 4/2008, 2008, roč. 50, č. 2, s. 1-3. ISSN 0322-8916.

Mičaník, T., Prchalová, H., Vyskoč, P., Fojtík, T. Vyhláška č. 44/2021 Sb. ze dne 1. 2. 2021, kterou se mění vyhláška č. 49/2011 Sb., o vymezení útvarů povrchových vod. . výsledky promítnuté do právních předpisů a norem: 44/2021 Sb. MŽP a MZe [CR, 2021]

Fremrová L., Baudišová D., Mičaník T., Hanslík E., Němejcová D., Mlejnková H., Polášek M., Peková A.. ČSN 757221 Kvalita vod - Klasifikace kvality povrchových vod . výsledky promítnuté do směrnic a předpisů nelegislativní povahy závazných v rámci kompetence příslušného poskytovatele: ČSN 757221 Úřad pro technickou normalizaci, metrologii a státní zkušebnictví (technicky připravil Sweco-Hydroprojekt a.s.) [CR, 2017]

Mičaník Tomáš, Kristová Alena Odvození norem environmentální kvality pro vybrané specificky znečišťující látky: arsen, fenthion, metolachlor a S-metolachlor. COM_PUBLICATIONS_LIST_PUBLIKACE_PODDRUH_STRATEGIE-KONCEPCE: 140186 (66358/ENV/14) Odbor ochrany vod MŽP [CR, 2017]

Mičaník Tomáš, Kristová Alena Odvození norem environmentální kvality pro vybrané specifické znečišťující látky: benzo(a)anthracen, bisfenol A, fenanthren, glyfosát, kyselinu aminomethylfosfonovou, kyselinu ethylendiamintetraoctovou, kyselinu 2-[Bis(karboxymethyl)amino]octovou, metazac. COM_PUBLICATIONS_LIST_PUBLIKACE_PODDRUH_STRATEGIE-KONCEPCE: 140186 (66358/ENV/14) Odbor ochrany vod MŽP [CR, 2016]

Mičaník Tomáš, Sýkora František Studie účelnosti vymezení mísicích zón podle § 6 vyhlášky č. 98/2011 Sb. v podmínkách České republiky. COM_PUBLICATIONS_LIST_PUBLIKACE_PODDRUH_STRATEGIE-KONCEPCE: 140186 (66358/ENV/14) Odbor ochrany vod MŽP [CR, 2016]

Eduard Hanslík, Eva Juranová, Tomáš Mičaník Podklady pro nařízení vlády 401 / 2015 Sb. v problematice radioaktivního znečištění vodního prostředí. výsledky promítnuté do právních předpisů a norem: 401/2015 Sb. MŽP ČR [CR, 2015]

Mičaník, T., Tušil, P. a Durčák, M. Příloha č. 1 a Příloha č. 3 k nařízení vlády č. 401/2015 Sb.. výsledky promítnuté do právních předpisů a norem: 401/2015 Sb. Ministerstvo životního prostředí ČR [CR, 2015]

Mičaník, T., Durčák, M., Kristová, A. Metodika odvození biologicky dostupných koncentrací vybraných kovů pro potřeby hodnocení chemického stavu útvarů povrchových vod. 2020, Sekce technické ochrany životního prostředí MŽP, 26. 3. 2020.

Durčák, M., Opatřilová, L., Vyskoč, P., Richter, P., Tušil, P., Filippi, R., Rosendorf, P., Mičaník, T., Kristová, A., Prchalová, H., Musil, J. Metodika hodnocení chemického a ekologického stavu útvarů povrchových vod kategorie řeka pro druhý cyklus plánů povodí v ČR. 2014, , 1. 11. 2030.

Durčák, M., Tušil, P., Mičaník, T., Rosendorf, P., Kristová, A., Vyskoč, P. Metodika hodnocení chemického stavu útvarů povrchových vod tekoucích (kategorie řeka). 2014, SekcetechnickéochranyživotníhoprostředíMŽP,Vršovická1442/65,Praha10, 25. 4. 2014.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Tomáš Mičaník, Pavel Rosendorf, Alena Kristová, Jitka Svobodová, Vít Kodeš Metodika hodnocení dopadu emisí na vodní prostředí. 2014, Odbor vodohospodářské politiky a protipovodňových opatření Ministerstva zemědělství ČR, Těšnov 17, Praha 1, ČR, 12. 12. 2014.

Durčák, M., Tušil, P., Mičaník, T., Rosendorf, P., Kristová, A., Vyskoč, P. Metodika hodnocení ekologického stavu útvarů povrchových vod tekoucích (kategorie řeka) – specifické znečišťující látky. 2014, SekcetechnickéochranyživotníhoprostředíMŽP,Vršovická1442/65,Praha10, 25. 4. 2014.

Tomáš Mičaník, František Sýkora, Jiří Šajer Metodika pro vymezování mísících zón podle § 6 vyhlášky č. 98/2011 Sb. v útvarech povrchových vod tekoucích (kategorie řeka). 2014, 1001-65-42, 25. 4. 2014.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Pavel Rosendorf, Alena Kristová a kol. Metodické postupy pro hodnocení významnosti jednotlivých typů zdrojů znečištění s ohledem na aplikaci imisně-emisního přístupu v oblasti ochrany vod. 2012, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,Vršovická65,10010Praha10, 25. 4. 2014.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Pavel Rosendorf, Alena Kristová a kol. Metodické postupy pro hodnocení významnosti jednotlivých typů zdrojů znečištění s ohledem na aplikaci imisně-emisního přístupu v oblasti ochrany vod. 2012, , .

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Pavel Rosendorf, Alena Kristová a kol. Metodické postupy pro hodnocení významnosti jednotlivých typů zdrojů znečištění s ohledem na aplikaci imisně-emisního přístupu v oblasti ochrany vod. 2012, , .

Mičaník, T., Vyskoč, P., Filippi, R., Richter, P. Jakost povrchových vod z hledisla plnění požadavků nařízení vlády č. 61/2003 Sb., ve znění pozdějších předpisů, matrice \\\\\\\"voda\\\\\\\", období 2006-2008: Všeobecné ukazatele. 2011, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,odborochranyvod,Vršovická1442/65Praha10,11010, 9. 12. 2011.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Filippi, R., Richter, P. Jakost povrchových vod z hledisla plnění požadavků nařízení vlády č. 61/2003 Sb., ve znění pozdějších předpisů, matrice \\\\\\\\\\\\\\\"voda\\\\\\\\\\\\\\\", období 2006-2008: Další syntetické a nesyntetické znečišťující látky. 2011, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,odborochranyvod,Vršovická1442/65Praha10,11010, 9. 12. 2011.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Filippi, R., Richter, P. Jakost povrchových vod z hledisla plnění požadavků nařízení vlády č. 61/2003 Sb., ve znění pozdějších předpisů, matrice \\\\\\\\\\\\\\\"voda\\\\\\\\\\\\\\\", období 2006-2008: Ukazatele sloužící pro vyhodnocení chemického stavu ůtvarů. 2011, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,odborochranyvod,Vršovická1442/65Praha10,11010, 9. 12. 2011.

Mičaník, T., Šlouf, V., Kodeš, V., Sýkora, F. Program na snížení znečištění povrchových vod nebezpečnými závadnými látkami a zvlášť nebezpečnými závadnými látkami 2010 – 2013. 2010, OdborochranyvodMŽP,Vršovická1442/65,Praha10,PSČ10010, 16. 4. 2010.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Richter, P., Filippi, R. Vyhodnocení jakosti povrchových vod ČR - prioritní látky podle SR 2008/105/ES. 2010, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,Odborochranyvod,Vršovická1442/65Praha10,10010, 9. 12. 2010.

Sýkora František, Mičaník Tomáš, Kristová Alena Část G: Programy pro jednotlivé prioritní a vybrané znečišťující látky. 2009, OdborochranyvodMŽP,Vršovická1442/65,Praha10,PSČ10010, 16. 4. 2010.

Mičaník, T., Sýkora, F., Šajer, J. Metodický návod na určení mísicích zón povrchových vod na území ČR. 2008, OOVMŽP, 20. 11. 2008.

Mičaník, T., Sýkora, F., Kristová, A. Program na snížení znečištění povrchových vod - rtuť a její sloučeniny. 2008, OOVMŽP, 20. 11. 2008.

Šajer J., Mičaník T., Sýkora F. Český imisní test (CIT). 2012. VÚV TGM, v.v.i., Česká republika.

Vyskoč, P., Richter, P., Mičaník, T., Filippi, R. Internetový portál pro publikaci výsledků vyhodnocení jakosti povrchových vod v profilech sledování. VÚV TGM, v.v.i., 2011.. 2011. VÚV TGM, v.v.i., Česká republika.

Mičaník, T., Sýkora, F., Kristová, A., Chrastina, D., Oceánský, J., Ocelka, T. Čistá voda – zdravé město, Koncept 1: Studie vnosu pesticidů do vodárenské nádrže Švihov (Želivka) s využitím nových vzorkovacích technik a odstranění organických látek ze sorpčních filtrů za ozonizací vysoce účinnou chemickou destrukcí. Výzkumná zpráva. Praha : Magistrát města Prahy, 2018, 39 s.

Mičaník, T., Sýkora, F., Kristová, A., Kučera, J., Novák, M., Čejková, J., Datel, V., Fojtík, T. Odborná podpora legislativních předpisů v rámci vodního hospodářství. Výzkumná zpráva. Praha : OOV MŽP, 2018, 14 s.

Dopady atmosférické depozice na vodní prostředí.

Mičaník, T., Ocelka, T., Oceánský, J., Novotný, P. Metodický a technologický postup eliminace vybraných pesticidů technologií CDC v laboratorním uspořádání.

Mičaník, T., Ocelka, T., Oceánský, J., Novotný, P. Metodický a technologický postup regenerace exponovaných sorpčních náplní na bázi aktivního uhlí v laboratorním uspořádání.

Mičaník, T., Ocelka, T., Oceánský, J., Novotný, P. Studie návrhu technologie eliminace škodlivých látek z exponovaných sorpčních náplní na bázi aktivního uhlí v provozním uspořádání.

Tušil, P., Mičaník, T. a Soldán, P. MPV6 – Voda v kajině.

Vyskoč, P., Beneš, J., Prchalová, H., Rosendorf, P., Kristová, A., Mičaník, T., Svobodová, J., Semerádová, S., Richter, P., Matoušová, L. Stanovení podílu emisí znečišťujících látek z různých zdrojů do povrchových vod.

Tušil, P., Ansorge, L., Drbal, K., Durčák, M., Kult, A., Mičaník, T., Prchalová, H., Rosendorf, P., Šajer, J., Vyskoč, P. Návrh činností souvisejících s naplňováním požadavků příslušných směrnic EU a národních právních předpisů v rámci 2.plánovacího cyklu v oblasti vod v období 2011-2016.

Tušil, P., Rieder, M., Durčák, M., Fuksa, J.K., Prachalová, H., Vyskoč, P., Rosendorf, P., Mičaník, T., Němejcová, D, Syrovátka, V., Kokeš, J. SWOT analýza systémů vymezení útvarů povrchových vod tekoucích.

Mičaník, T., Bečvář V. Problematika revizí domovních ČOV podle § 15a vodního zákona. Novotného lávka 5, Praha 1, Česká republika. 12. 9. 2018 - 12. 9. 2018

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Tomáš Mičaník, Pavel Rosendorf, Alena Kristová, Jitka Svobodová Workshop k problematice hodnocení dopadu emisí na vodní prostředí. Praha, Česká republika. 16. 4. 2014 - 16. 4. 2014